《qPCR檢測的私隱問題》
PCR是複製DNA的方法，過程需要稱為「引物」(primer)的物質。簡單說，引物是一個引子，包含了指定序列，你可以當是Microsoft Word裡的Find功能，一般是有一對，簡稱F和R，分別代表從何開始，從何結束。PCR，就是由起始引子相應的序列，複製到結束引子相應的序列。打個比方，起始引子是「我們在天上的父」，結束引子是「直到永遠，阿門。」，PCR就會把整段《主禱文》複製出來。
檢測武漢病毒的qPCR，一般進行兩到三組，各有一對primer，分別對應武漢病毒的不同基因。理論上，如果這Find功能找到了武漢病毒的基因，就會將其複製倍化，過程發出螢光訊號。觀察螢光，就可以估計有否倍化。而為了確保樣本有人類基因以及PCR過程順利，以減低假陰性機會，最理想是同時用對應人類基因的primer，因為理論上如果樣本沒問題，一定會有人類基因。（這又稱作內部對照組/internal control)
實驗設計上，這是非常合理的。然而從私隱層面上，政府或公司有權倍化人類的基因嗎？本來的primer設計，是從你的電腦文件中複製《主禱文》，但只要將primer換成「全澳門最大」和「上線啦」，就可以複製出《賭場廣告》，便知道你有沒有看AV了。誰授權政府，可以用這primer，不可以用那primer呢？
用特定primer組合來找出器官匹配度相關資訊，這種隨便想都能想到的方法，當然有人做了，而且廿幾年前已經做了。這說明單單用檢測武漢病毒同樣的檢測平台，足以找出你各樣基因資訊。
當然，現在有更多更先進的方法，不用靠PCR。我們系統性地交出人類樣本，中間有什麼人處理，拿來做過什麼實驗，更無人知曉。
然而，政府並無公開他們用什麼primer組合，什麼實驗設計，什麼準則判定陽性，更遑論樣本的處理過程（之前就發生了公司交叉感染樣本的情況。）。另邊廂，我們也從不討論這技術必然會引伸的私隱問題。
很多本業就是做人類基因定序的公司，得了這麼大量的人類樣本，難道不會偷偷看一眼？難道陳冠希叫你幫他修電腦，你不會看一眼？
（用PCR找出你器官匹配度的方法：
https://link.springer.com/protocol/10.1007%2F978-1-62703-493-7_8）
定序primer設計 在 Re: [求救] PCR定序結果forward跟reverse完全不同- 看板Biotech 的推薦與評價
不好意思，前兩天學校大停電~
整個都呈現無電狀態@@
現在才看到大家的回覆~~
→ Ice9: design another forward primer to read through the end… 07/02 17:46
→ roy047: reverse亂黏, 可重新設計或是同一樓 07/03 14:54
其實我一開始是先用定序公司提供的序列，
現在已有在設計一段序列使用，
等待重新定序。
→ xxtomnyxx: Reverse 的定序 AB1 圖是單一 peak 但是序列都不對嗎？ 07/03 22:09
從revers端去看幾乎都是錯置的，
貼圖一下
長度偏短，
且幾乎都是錯置居多。
而forward端
則是
長度為1050 bp，
除了前後端外，
幾乎都是單一paek，
而且符合我的預期結果。
→ blence: 看起來insert超過1k？ 07/04 00:26
送入片段為 1092bp
→ supray: 可能你的reverse primer有多個binding site吧? insert中有 07/04 23:46
→ supray: 相似序列? 07/04 23:46
應該是不會
1. M13F (-40) 5'-CAG GGT TTT CCC AGT CAC GAC-3'
2. M13R(-48) 5'-AGC GGA TAA CAA TTT CAC ACA GG-3'
3. M13F(-20) 5'-GTA AAA CGA CGG CCA GT-3'
4. M13R(-24) 5'-AAC AGC TAT GAC CAT G-3'
有比對過，
專一性都算滿高的~
→ supray: 同一樓 從已定出的序列設計新primer 07/04 23:49
恩恩，
希望這次的定序會準一些 QAQ
上次超神挑的，
1/5的機率也能讓我挑到錯誤的位置，
回來比對整個傻眼了。
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