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primer設計方法 在 コバにゃんチャンネル Youtube 的最佳貼文
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另外,需注意primer設計時序列會不會自行黏合,也盡量避免設計到迴文序列,基本上這樣 ... 特別聲明本方法可允許轉載編輯,但請註明來源作者-- ※ 編輯: andy731 來自: ... ... <看更多>
Learn how to design large-scale systems. ... system-design-primer/README-zh-TW.md at master ... 針對你的設計討論可能的解決方法與代價。每個設計都有取捨。 ... <看更多>
#1. 設計primer流程(捷登)
設計primer 流程. 使⽤用時機:. 1. qPCR 時使⽤用(片段較短,<250 bp). 2. ⽤用於⼀一般PCR 驗證. 3. ⽤用於質體建構時的target gene 製備(需恰好使⽤用整段完整的 ...
#2. [試劑耗材] 點突變primer設計人人都可上手- QuikChange ...
和一般的PCR比起來在primer的設計和反應參數等都大不相同 ... 轉成胺基酸序列對於蛋白點突變的實驗來說較為簡便這邊將以此方法來做後續使用說明
2.直接跳到NCBI的Primer-BLAST頁面,提交的界面主要包括四個部分:PCR template(模板區), Primer Parameters(引物參數區), 和Exon/intron selection( ...
... 核酸序列預測出數個最適合的primer,以節省設計primer的時間,並協助實驗的進行。 ... 時,為了將這一段以PCR 方法amplify 出來,使用者才必須界定target region。
qPCR生物技術是一種用來偵測mRNA表達量最可靠也最常用的技術之一,qPCR作為PCR技術的分支其primer的設計也同樣必須遵循PCR primer設計的規則,如此一來才能得到可靠 ...
#6. Primer Express v3.0 中文操作手冊
Primer Express Operation Guide. 2. Primers/Probes Design Guideline. TaqMan Probe. Primer. Probe 與Primer 的距離愈近愈好, PCR 產物大小建議在50-150 bp 為最佳.
#7. Schedule/ Lecture/Primer design
設計primer 的輔助工具. PCR (Polymerase Chain Reaction, 聚合?鏈反應) 是根據DNA複製的原理, 使特定DNA 片段大量複製, 由變性(denature)、黏接(annealing)、 ...
因此该工具尤其适合设计特异性的荧光定量或半定量PCR引物。下面,将详细介绍这种特异性qPCR引物的设计方法:. 1. 找到基因序列页面. 2. 跳转到Primer ...
#9. 如何用Primer-Blast設計和驗證引物_解螺旋- 微文庫
更強大的是Primer-BLAST能設計出只擴增某一特定剪接變異體基因的引物。Primer-BLAST有許多改進的 ... lncRNA 的研究策略和技術方法(索引號:282).
#10. 輸入核酸序列以搜尋引子(Primer) step2
另外,針對樹形圖的輸出方式,與樹形分支排列調整等功能設計程式,以符合客製化(customize)的理想。 ... step5: PDA 也能為Nested PCR 方法設計合適之引子.
#11. 引子使用說明 - 基龍米克斯生物科技
保存方法冷凍乾燥的DNA 非常穩定,可以在-20 ℃ 下保存幾年, 4 ℃ 可以保存6 個月左右; ... 計算引子稀釋濃度的方法 基本參數及計算公式: MW( 分子量)=(A bases x ...
#12. primer 設計方法【技術】使用NCBI設計qPCR引物 - Aiiedw
primer 設計方法 【技術】使用NCBI設計qPCR引物 ... PrimerX: Primer Design Based on DNA Sequence ... 手把手教你miRNA研究套路及引物設計方法– 肽…
#13. 引子合成常見問題與解答(FAQ) - AccuBioMed
在引子合成過程中,除了人為將序列輸錯(可核對合成報告單),化學合成方法本身 ... 引子不純可能會導致: 1) 非專一性擴增; 2) 無法用預先設計在引子5' 端酶切位點的 ...
#14. 研究材料與方法
二、研究方法. 1 clone 視蛋白 ... 1.4 設計Rh1 group退化引子(degenerate oligonucleotide primers) ... 上述退化PCR主產物核苷酸序列設計5'、3'端專一引子為.
#15. Primer and Probe Design Tools – 群體健康科學研究所
PDA:Primer Design Assistant 線上核酸引子設計工具,容許一次單筆或多筆核酸序列資料同時進行線上最佳化分析,均一化所需批次進行的PCR反應條件.
#16. TW201643248A - 核苷酸序列、通用反向引子 - Google Patents
本發明提供一種具有SEQ ID NO:1的核苷酸序列、具有SEQ ID NO:2的通用反向引子、通用反轉錄引子、引子設計方法以及miRNA檢測方法。於miRNA檢測方法中,使用所述通用反 ...
#17. Gene Cloning | 如何將目標基因克隆到載體中(上) - ACE Biolabs
而ACE Biolabs 也有提供管柱的方法 (ACExtract DNA Isolation Kit(from Cell/Tissue, ... 網路上有很多免費的引子設計軟體,可以自己調整長度、GC ...
#18. 建立腸病毒即時定量PCR 之分析系統
方法 是根據腸病毒5' 端non-coding region (此區為腸病毒高保守. (high-conserved)區域)設計引子以單一步驟(one-step)的RT-PCR[3]增幅.
#19. 實驗室服務 - 源資國際生物科技
Q : 定序用Primer 設計要注意什麼? A:. 18 bp < Primer < 25 bp ... Q : 是否可利用帶有螢光的PCR product 或帶有螢光的primer做DNA 定序?
#20. pcr程序如何設計Primer設計PCR引物的方法 - Khzcs
你有想過它為什么總是出現在你的實驗結果中嗎? RNA-seq和qRT-PCR一致性評估-學習視頻教程-騰訊課堂. 系統地介紹如何篩選驗證基因,快來試試吧。 CRM產品該如何設計和 ...
#21. 聚合酶連鎖反應- 維基百科,自由的百科全書
但是,沒有採用正常細胞常溫解旋的方法,而是把雙鏈DNA加熱到96℃,使得雙鏈分離成為 ... 引子的設計技術在改善聚合酶連鎖反應產物產率和避免雜產物的形成是很重要的。
#22. DNA Sequencing核酸定序設施 - IBMS, Sinica - 中央研究院
What notes should I take of primer design? ... 請各位統一採用A4紙張,直式列印,投入信箱的模式是,反面朝上,正面的最前端朝左邊(信箱的上面有標示方法)。
#23. IJAIT 11(2)_03.pdf - cyut.edu.tw - 朝陽科技大學
的方法來設計聚合酶鏈鎖反應-限制性片段長. 度多型性(Polymerase Chain Reaction-. Restriction Fragment Length Polymorphism,. PCR-RFLP)的誘發突變引子,用於單核苷 ...
#24. 博碩士論文行動網
論文摘要本研究論文主要為開發引子設計(primer design)方法及發展使用者需要的單一核苷酸多型性(single nucleotide polymorphism, SNP)系統以輔助生物學者及研究人員進行 ...
#25. 引子合成Primer Synthesis - 百力生物科技股份有限公司
依此方法生產的引子純度可比去鹽純化提高至少10%。然而,OPC 純化的解析力無法 ... 且純度要求高的引子。特別推薦用於基因合成以及RNAi vector design 的實驗設計。
#26. 聚合酶連鎖反應儀儀器操作(StepOnePlus) 暨基因定量技術應用 ...
試劑配製注意事項Primer/ Probe 設計介紹. 3. StepOnePlus 儀器介紹及使用注意事項. 4. StepOnePlus 軟體簡介及結果分析演練 ... qPCR常用螢光偵測方法.
#27. 小知識分享 怎麼做都無法得到甲基化PCR產物嗎? 換個方法試 ...
影響bisulfite PCR的成功與否,除了primer設計因素以外,還有許多會影響成功率的眉眉角角,以下針對我們目前遇過的案例做個簡單的失敗因素統整:.
#28. 2018/5/24 1 教育部高中生物科學資優生培育計畫-高雄區授課教師
細菌的接合作用(conjugation)是細菌間傳遞遺傳物質的方法之一, ... Design the primer pairs, 15-mer for each, to amplify the gene.
#29. primer設計– 引子設計 - 22tandm
PCR プライマー: 設計方法、汎用プライマーの配列など. primer設計. プライマー設計. Primer & TaqMan Probe設計方案. 縮重プライマー(degenerate primer)の設計は ...
#30. 類症病原群多重基因目標的早期鑑別檢測應用
本項論文實作PDA-UniQ/MS特異群/最小群-探針引子設計演算法,前篩選階段利用四核苷 ... 最小群擴增引子應用於檢體核酸聚合鏈反應型(PCR)訊號擴增的電化學檢測方法,與 ...
#31. 引子設計 - 政府研究資訊系統GRB
with confronting two-pair primers; PCR-CTPP)是一種便宜且快速的單一核苷酸基因定型(genotyping)方法,然而,目前市面上卻缺乏一套高產量之PCR-CTPP 引子設計演算法 ...
#32. 時間 - 衛生福利部食品藥物管理署
(二)臨時動議1:目前微生物檢驗方法的取樣量大多訂定為50 公. 克,是否評估減量取樣, ... 比對TFDA與歐盟JRC 設計CV127 primer/probe 的序列區段有重疊,可參. 考如下:.
#33. 抗嘉磷塞大豆之基因特性及PCR 檢測
理想之PCR 檢測條件決定於檢體DNA 抽取的純. 度、回收率以及引子(primer) 的設計,皆會影響檢出結果之專一性及. 靈敏度。基因改造生物體及食品以PCR 方法檢測轉殖之基因, ...
#34. 分析服務 - 正茂生物科技
目前使用的技術平台建立於Bio-Rad 即時定量聚合酶鏈鎖反應儀CFX 系列,從包含前期由技術成熟的專員溝通、引子設計、實驗方法的選擇及後續的數據討論等皆在我們的服務 ...
#35. 恆溫環狀擴增法在動植物防檢疫之應用(農委會)
近年有一種新的生化方法--恆溫環狀擴增法(LAMP, Loop-mediated isothermal ... 以及環狀引子對(loop primers),其中的引子對必須針對目標物序列的特異區而加以設計, ...
#36. 設計primer網站 - 藥師家
相關資訊 · ncbi設計primer · primer design · primer設計 · pcr primer設計 · 設計primer的方法 · qpcr primer設計 · reverse primer設計 · find primer ...
#37. 有效計算智慧為主的方法用於誘發突變引子設計- 月旦知識庫
鄭煜輝,郭哲男,計算智慧,聚合酶鏈鎖反應-限制性片段長度多型性,誘發突變引子,單一核苷酸多型性,限制酶,Computational intelligence,PCRRFLP,mutagenic,月旦知識庫, ...
#38. (十) 即時定量聚合酶連鎖反應(Real-time Quantitative ...
Q-PCR技術利用專一的Primer probe(引子探針)會在PCR(聚合酶連鎖反應)過程中. 產生螢光,再利用螢光偵測系統(Ex.ABI 7900HT Detection system)來偵測每個循.
#39. LAMP 技術專刊
DNA 雙股打開;除此之外,LAMP 的primer 經過特殊設計,共4 條,分別為下圖中 ... 計primer 搭配原廠試劑使用,primer 設計方法請見第7 頁的介紹。
#40. 郭柏宏,刘璐萍 - abc
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#41. 共同研究室電子報
過程中使用的保存方法、萃取方式、RNA品質、反轉錄酶的廠牌、Primer設計的片段、分析方法等,種種變因是無法在發表的期刊上得知,也因為缺乏足夠的研究資訊,導致研究 ...
#42. 聚合酶連鎖反應(PCR)
PCR引子&設計. Invitrogen客製DNA寡核苷酸及設計工具,打造成功PCR ... Applied Biosystems分析方法、試劑和儀器,適用於qPCR和dPCR實驗 ...
#43. Real Time PCR (qPCR) Kit - 探索生物科技
利用生物資訊演算設計miRNA primer來開發用於偵測miRNA表現的real time RT-PCR分析。 廠牌: CANOPY. 進入官網. 聯絡我們. Real Time PCR. 螢光定量PCR用Taqman方法 ...
#44. 引子 - A+醫學百科
PCR引子設計的目的是找到一對合適的核苷酸片段,使其能有效地擴增模板DNA序列。 ... 降低引子與模板相似性的一種方法是,引子中四種鹼基的分布最好是隨機的,不要有聚 ...
#45. 多方位基因體分析服務
此方法. 可用於分析含SNP、CNV、InDel等各種不同型式之序列變異性。 在單一反應最多可設計四十組不同SNP位點的Multiplex PCR反應,由於利用質譜儀直接偵測primer質量, ...
#46. 產品資訊| 鼎捷生技有限公司
此QPCR方法可以檢測蛋白質與DNA在已知基因組結合位點的交互作用,也可以針對未知的結合位點設計潛在調控區域(如:啟動子)的引子對。 ChIP-QPCR在特定基因的潛在調控 ...
#47. 行政院國家科學委員會專題研究計畫成果報告 - 國立高雄應用 ...
基於粒子最佳化方法之PCR-RFLP 引子設計及系統開發. 研究成果報告(精簡版) ... Nucleotide Polymorphism, SNP)進行限制酶探勘及引子設計. 的工作。由於許多的引子設計 ...
#48. 法規名稱: 非洲豬瘟檢驗方法
步驟與方法: (1)引子(primers)及探針(probe)設計: 定量聚合酶鏈反應技術已被應用在非洲豬瘟的診斷上,利用OI E推薦的非洲豬瘟病毒特異性引子對(pairof primer) ...
#49. 工具手把手教你用Primer-Blast設計和驗證引物,五星推薦!
基於在標準和長PCR、反向PCR引物的設計新方法,直接胺基酸序列的簡併PCR、多重PCR和電子PCR;序列比對、聚類和任何重複序列搜索。Beacon Designer是一款 ...
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#51. [方法] 設計跨Intron primer的方法- 看板Biotech | PTT職涯區
另外,需注意primer設計時序列會不會自行黏合,也盡量避免設計到迴文序列,基本上這樣 ... 特別聲明本方法可允許轉載編輯,但請註明來源作者-- ※ 編輯: andy731 來自: ...
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... 想出了一個方法可以把非常少量的核酸DNA放大,這個方法叫做聚合酶連鎖 ... 本篇所列舉的引子設計為默克藥廠現階段所釋出,引子序列設計隨著研究者 ...
#53. 應用非酶切系統偵測單一核苷酸變異
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#56. 即時定量聚合 鏈鎖反應
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#57. 高效率的Real-Time PCR System - 創世紀生技有限公司
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#58. 聚合酵素鏈鎖反應
這個方法的原理十分簡單,在要擴增的DNA片段兩端分別設計一個前置引子(forward primer)和反置引子(reverse primer)使之與已變性的單股目標DNA緩冷配對(annealing)後,利用 ...
#59. donnemartin/system-design-primer · GitHub - 系統設計入門
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#60. 台灣醫檢雜誌- ALL ISSUES - 台灣醫事檢驗學會
根據Makimura等[14]的報告顯示,在真菌較保守性的18S rDNA序列中設計合成一對普遍性引子,以PCR的方法來識別真菌種類,其偵測靈敏度可達1 pg的DNA。
#61. Primer 3 在线引物设计攻略_实验方法 - 丁香通
开始之前:其实非常简单,不需要你下载任何软件,但是你得有一台电脑能上网。当然,最重要的是,你要很清楚用于做引物的模板序列,至于怎么找模板序列 ...
#62. 行政院農業委員會公告
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#63. [方法] 設計跨Intron primer的方法- 看板Biotech - 批踢踢實業坊
1.先在data base上找到目標基因的genomic gene 序列及目標基因的mRNA 序列2.將兩序列儲存至同一個文字文件( .txt檔) 3.利用Bioedit軟體將兩序列開啟.
#64. 如何设计PCR 引物 - 汉恒生物
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#65. Primer-BLAST:NCBI的引物设计和特异性检验工具
Primer -BLAST,在线设计用于聚合酶链反应(PCR)的特异性寡核苷酸引物。Primer-BLAST可以直接从Blast主页(http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/)找到,或是直接用下面的 ...
#66. Kary B. Mullis - 輔仁大學生命科學系
此後,PCR的運用一日千里,相關的論文發表質量可以說是令眾多其他研究方法難望其項背。 ... 其原理十分簡單,先在要擴增的DNA片段兩端分別設計一個前置引子(forward ...
#67. 生物資訊及系統生物研究所 - 國立交通大學
定方法需要花費大量的時間與昂貴的設備,為了快速且有效地鑑定維生物,在本 ... 項genomic feature,將這些structural RNA 的conserved region 設計成引子,憑藉著在.
#68. 非洲豬瘟檢驗方法
1. 步驟與方法:. (1) 引子(primers)及探針(probe)設計:. 定量聚合酶鏈反應技術已被應用在非洲豬瘟的診斷上,. 利用OIE 推薦的非洲豬瘟病毒特異性引子對(pair of.
#69. 突變分析報告書的解讀 - BIOMEDICINE
目前檢測突變的方法有許多種。每一種突變分析 ... 瞭解這些分析方法的步驟及其靈敏度,有助於我們解讀突變分析報告書 ... 幅後,由於內引子對序列設計的特性,因此反應.
#70. (19) 中華民國智慧財產局(12)發明說明書公告本(11)證書號數
同時檢測四種病毒引子、引子對、方法及套組 ... 於利用蘭花病毒專一性引子及引子對同時檢測數種蘭花病 ... 本發明依病原的特定基因序列設計專一性引子,成功的.
#71. 腸道病毒實驗檢驗技術之研習
美國疾病管制局小兒麻痺病毒與小RNA 病毒實驗室學習,基因檢測新的設計方法,能找尋到 ... 每一個RT-PCR 反應50 μl 含67 mM Tris–HCl, pH 8.8, 1 μM primers, 17.
#72. 水試所電子報第123期
宮正樹博士在增幅DNA時使用two-step tailed PCR的方法來克服,即設計兩組帶有尾巴的引子,第二組primer可以搭上第一組primer的尾巴,進行第二次增幅,將訊號再作一次 ...
#73. CCMP99-RD-021 新型核酸分子等溫擴增技術於中藥材基因體 ...
使用DNA分子鑒定技術的研究方法,是對於中藥材基原的基因多態性在分子層次上的檢測, ... 擴增方法,其特點是針對目標基因中的6個特異區域設計4種特異引子(Primer),在 ...
#74. 引物不特异?不如试试利用NCBI设计。 - 手机搜狐网
打开“Primer-BLAST”页面,在“Primer Parameters”条目下的两个框框里分别 ... 大家推荐屡试不爽的引物设计方法,就是用NCBI在线设计,主要步骤如下:.
#75. 科研乾貨丨手把手教你做PCR引物設計! - GetIt01
Tm值的計算有多種方法,如按公式Tm=4(G+C)+2(A+T),在Oligo軟體中使用的是最鄰近 ... 插播:後台回復【引物設計軟體】即可Oligo/DNAstar/Primer premier5/6/DNAstar ...
#76. 即時聚合酶鏈反應Real-time PCR食品檢測 - 台美檢驗
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#77. 定序服務 - 翰新國際有限公司
12.若對實驗方法或結果有疑問,歡迎使用e-Mail 或電話與本公司技術人員討論。 送件表格下載. 空白定序單. 定序引子列表. 下表為本 ...
#78. NCBI中primer-blast使用方法? - 劇多
參考資料:Primer-BLAST是NCBI的引物設計和特異性檢驗工具。線上設計用於聚合酶鏈反應(PCR)的特異性寡核苷酸引物。免除了用另一個站點或工具設計引物的 ...
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#80. PCR/qPCR/dPCR实验设计
剪接体的分析需要根据靶标专门设计方法。 ... An improved allele-specific PCR primer design method for SNP marker analysis and its application. Plant Methods.
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#82. 利用SSCP 建立骨碎補科植物LEAFY 基因之PCR 引子以探討陰 ...
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#83. (19) 中華民國智慧財產局
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17. POCKIT™的引子在設計上與一般的PCR試劑有何不同?
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#87. 用NCBI中Primer Blast快速设计探针引物 - 360doc个人图书馆
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本公司目前所提供的PCR 服務項目包含引子設計(SYBR),引子代訂(TaqMan),cDNA 合成與QPCR 服務。 產品介紹; 詳細規格; 產品特點 ... 目前提供QPCR 偵測的方法有:.
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此方法設計的長片段primer中,除了16S region的primer以及Illumina adapter之外,還另外加上了”Pad”和”Linker”的序列,這兩段序列是為了避免長片段之 ...
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primer設計方法 在 [方法] 設計跨Intron primer的方法- 看板Biotech - 批踢踢實業坊 的推薦與評價
1.先在data base上找到目標基因的genomic gene 序列
及
目標基因的mRNA 序列
2.將兩序列儲存至同一個文字文件 ( .txt檔 )
3.利用Bioedit軟體將兩序列開啟
4.執行軟體上方sequence選項內的Pairwise alignment裡的
Align two sequences(optimal GLOBAL alignment) 選項
5.待軟體計算完,即可得到 genomic gene序列
+
已經對齊好的 mRNA序列
Ex:
genomic ACGTATTGTCAACTGAGCGATCTCCGTAAAGTTAGTTCGATCACACGTCAGCTACGATCTCGTA
mRNA ACGTATTGTCAACTGAGCGATCTC------------------------------CGATCTCGTA
^^^^^^^^^^^^ ^^^^^^^^
(12 mer) (8 mer)
AT: 8 mer
CG: 12 mer CG% = 60 %
primer序列:CTGAGCGATCTCCGATCTCG
6.primer設計技巧
設計此primer是為了要避免掉genomic DNA的干擾
Taq在合成PCR產物時靠的是primer 3'端是否有黏接完全,
換句話說~3'端若是沒有黏接DNA template即無法合成出產物
因此 在設計primer時,可採用5'端序列長度較長(約10~14個mer)
3'端序列較短(約8~10個mer),而本人習慣設計高GC比(約55~65%間)
因這樣annealing溫度可以提高,增加primer專一性,且可以排除那
些3'端黏合在模板上的機率。另外,需注意primer設計時序列會不會
自行黏合,也盡量避免設計到迴文序列,基本上這樣的primer專一性
都會很高。
另外補充 1.AT在計算Tm值時 皆算2度
CG 4度
所得的溫度減5度,即可當做抓最適條件時annealing的溫度
2.設計Antisense時,請記得將該序列反轉並倒寫
正常序列 Ex.CTGAGCGATCTCCGATCTCG
反轉+倒寫 CGAGATCGGAGATCGCTCAG
------------------------------------------------------------------------
因本身是非生技本科系學生,一路走來真的很辛苦,也碰到很多挫折
因此,提供一些基本知識來讓像我一樣背景的同學能夠讓實驗快速上手
祝大家早日脫離苦海吧!!
特別聲明 本方法可允許轉載編輯,但請註明來源作者
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※ 編輯: andy731 來自: 192.83.195.230 (04/03 02:09)
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